How can i optimize this query?

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MySQL

I'm working with network monitoring tool called pandorafms. In console view, it has a page named tactical view. this page shows summery of the all monitoring agents and monitoring modules. my question is not related to networking. it is about coding, there is a sql query running on that page. it take about 20sec to execute every time. i need to reduce the executing time. my question is how do i optimize it and is there any configuration need for mysql database? if need; how do i configure it? I'm new to the programming.I need a little help.

-sql query is given below-

# Query_time: 17.830726  Lock_time: 0.000093 Rows_sent: 1  Rows_examined: 0
SET timestamp=1356521617;
SELECT COUNT(*) FROM ( SELECT DISTINCT tagente.id_agente
                                                FROM tagente, tagente_modulo, tagente_estado
                                                WHERE tagente.id_agente = tagente_modulo.id_agente
                                                AND tagente_modulo.id_agente_modulo = tagente_estado.id_agente_modulo

                                                AND tagente.id_grupo IN (9)
                                                AND tagente.id_agente NOT IN (SELECT tagente.id_agente
                                                FROM tagente_estado, tagente, tagente_modulo
                                                WHERE tagente_estado.id_agente = tagente.id_agente
                                                AND tagente_estado.id_agente_modulo = tagente_modulo.id_agente_modulo
                                                AND tagente.disabled = 0
                                                AND tagente_modulo.disabled = 0
                                                AND estado = 1
                                                AND tagente_estado.utimestamp != 0
                                                AND tagente.id_grupo IN (9)
                                                group by tagente.id_agente)
                                                AND tagente.id_agente NOT IN (SELECT tagente.id_agente
                                                FROM tagente_estado, tagente, tagente_modulo
                                                WHERE tagente_estado.id_agente = tagente.id_agente
                                                AND tagente_estado.id_agente_modulo = tagente_modulo.id_agente_modulo
                                                AND tagente.disabled = 0
                                                AND tagente_modulo.disabled = 0
                                                AND estado = 2
                                                AND tagente_estado.utimestamp != 0
                                                AND tagente.id_grupo IN (9)
                                                group by tagente.id_agente)
                                                AND tagente.id_agente IN (SELECT tagente.id_agente
                                                FROM tagente_estado, tagente, tagente_modulo
                                                WHERE tagente_estado.id_agente = tagente.id_agente
                                                AND tagente_estado.id_agente_modulo = tagente_modulo.id_agente_modulo
                                                AND tagente.disabled = 0
                                                AND tagente_modulo.disabled = 0
                                                AND estado = 3
                                                AND tagente_estado.utimestamp != 0
                                                AND tagente.id_grupo IN (9)
                                                group by tagente.id_agente) ) AS t;